Hola jpl,
Tienes que conseguir aumentar el tiempo de exposición de cada fotograma. Efectivamente luego puedes procesar el vídeo como si fuera de planetaria, pero con otros proceados específicos para DSOs. Por ejemplo el mismo
Autostakkert! 2 te vale para ambas tareas.
Yo también estoy comenzando a probar mi cámara de planetaria en espacio profundo. Este es un ejemplo de M42 con tomas de 1 segundo:
https://www.astrobin.com/154998/